Il y a tellement de faits scientifiques que les scientifiques et même le grand public tiennent pour acquis dans notre société moderne. Cependant, bon nombre de ces disciplines que nous pensons maintenant être du bon sens n'avaient pas encore été discutées dans les années 1800 lorsque Charles Darwin et Alfred Russel Wallace ont d'abord mis en place la théorie de l'évolution à travers sélection naturelle. Bien qu'il y ait eu beaucoup de preuves que Darwin connaissait lors de la formulation de sa théorie, il y a beaucoup de choses que nous savons maintenant que Darwin ne savait pas.
La génétique, ou l'étude de la façon dont les traits sont transmis des parents à la progéniture, n'avait pas encore été étoffée lorsque Darwin a écrit son livre À propos de l'origine des espèces. Il a été convenu par la plupart des scientifiques de cette période que la progéniture avait bien obtenu ses caractéristiques physiques de ses parents, mais comment et dans quels ratios n'était pas clair. C'était l'un des principaux arguments opposés à l'époque à Darwin contre sa théorie. Darwin n'a pas pu expliquer, à la satisfaction de la première foule anti-évolution, comment cet héritage s'est produit.
Ce n'est qu'à la fin des années 1800 et au début des années 1900 que Gregor Mendel a fait son travail de changement de jeu avec ses plants de pois et est devenu connu comme le «père de la génétique». Même si son travail était très solide, il soutien mathématique et a raison de dire qu’il a fallu un certain temps à quiconque pour reconnaître l’importance de la découverte par Mendel du la génétique.
Comme le domaine de la génétique n'existait pas avant les années 1900, les scientifiques de l'époque de Darwin ne cherchaient pas la molécule qui transporte les informations génétiques de génération en génération. Une fois que la discipline de la génétique s'est répandue, de nombreuses personnes ont couru pour découvrir quelle molécule portait cette information. Enfin, il a été prouvé que ADN, une molécule relativement simple avec seulement quatre blocs de construction différents, est en effet le porteur de toutes les informations génétiques pour toute la vie sur Terre.
Darwin ne savait pas que l'ADN devenir une partie importante de sa théorie de l'évolution. En fait, la sous-catégorie de l'évolution appelée microévolution est entièrement basé sur l'ADN et le mécanisme de transmission de l'information génétique des parents à la progéniture. La découverte de l'ADN, de sa forme et de ses éléments constitutifs a permis de suivre ces changements qui s'accumulent au fil du temps pour conduire efficacement l'évolution.
Une autre pièce du puzzle qui donne des preuves à la Synthèse moderne de la théorie évolutionniste est la branche de la biologie du développement appelée Evo-Devo. Darwin n'était pas au courant des similitudes entre les groupes d'organismes différents avec la façon dont ils se développent de la fécondation à l'âge adulte. Cette découverte n'est apparue que longtemps après que de nombreuses avancées technologiques ont été disponibles, telles que des microscopes de grande puissance, et que des tests in vitro et des procédures de laboratoire ont été perfectionnés.
Les scientifiques d'aujourd'hui peuvent examiner et analyser comment un zygote unicellulaire change en fonction des indices de l'ADN et de l'environnement. Ils sont capables de suivre les similitudes et les différences des différentes espèces et de les retracer jusqu'au code génétique de chaque ovules et spermatozoïdes. De nombreux jalons de développement sont les mêmes entre des espèces très différentes et indiquent l'idée qu'il existe un ancêtre commun pour les êtres vivants quelque part sur l'arbre de vie.
Même si Charles Darwin avait accès à tout un catalogue de fossiles qui avait été découvert dans les années 1800, il y a eu tellement de découvertes de fossiles supplémentaires depuis sa mort qui constituent une preuve importante qui soutient la théorie de l'évolution. Beaucoup de ces «nouveaux» fossiles sont ancêtres humains qui aident à soutenir l’idée de Darwin de «descente par la modification» des humains. Alors que la plupart de ses preuves étaient circonstancielles lorsqu'il a émis pour la première fois l'hypothèse que les humains primates et étaient liés aux singes, de nombreux fossiles ont depuis été trouvés pour combler les blancs de l'évolution humaine.
Alors que l'idée de l'évolution humaine est encore très sujet controversé, de plus en plus de preuves continuent d'être découvertes qui aident à renforcer et à réviser les idées originales de Darwin. Cette partie de l'évolution restera très probablement controversée, cependant, jusqu'à ce que tous les intermédiaires fossiles de l’évolution humaine ont été découverts ou la religion et les convictions religieuses des gens exister. Puisqu'il est peu probable que cela se produise, il y aura toujours une incertitude concernant l'évolution humaine.
Un autre élément de preuve que nous avons maintenant pour soutenir la théorie de l'évolution est la façon dont les bactéries peuvent s'adapter rapidement pour devenir résistantes aux antibiotiques ou à d'autres médicaments. Même si les médecins et les médecins dans de nombreuses cultures avaient utilisé la moisissure comme inhibiteur des bactéries, la première découverte et utilisation d'antibiotiques répandues, comme la pénicilline, n'a eu lieu qu'après la mort de Darwin. En fait, la prescription d'antibiotiques pour les infections bactériennes n'est devenue la norme qu'au milieu des années 1950.
Ce n'est que des années après que l'utilisation généralisée des antibiotiques est devenue courante que les scientifiques ont compris qu'une exposition continue aux antibiotiques pouvait les bactéries évoluent et devenir résistant à l'inhibition causée par les antibiotiques. Il s'agit en fait d'un exemple très clair de sélection naturelle en action. Les antibiotiques tuent toutes les bactéries qui ne lui sont pas résistantes, mais les bactéries résistantes aux antibiotiques survivent et prospèrent. Finalement, seules les souches bactériennes résistantes à l'antibiotique fonctionneront, ou "la survie du plus fort"des bactéries ont eu lieu.
Il est vrai que Charles Darwin possédait une quantité limitée de preuves pouvant entrer dans la catégorie phylogénétique, mais beaucoup de choses ont changé depuis qu'il a proposé pour la première fois la théorie de l'évolution. Carolus Linnaeus avait un système de nommage et de catégorisation en place pendant que Darwin étudiait ses données, ce qui l'a aidé à formuler ses idées.
Cependant, depuis ses découvertes, le système phylogénétique a radicalement changé. Au début, des espèces ont été placées sur l'arbre de vie phylogénétique sur la base de caractéristiques physiques similaires. Beaucoup de ces classifications ont été modifiées depuis la découverte des tests biochimiques et du séquençage de l'ADN. Le réarrangement des espèces a impacté et renforcé la théorie de l'évolution en identifiant relations auparavant manquées entre les espèces et lorsque ces espèces se sont éloignées de leur les ancêtres.