Une partie du synthèse moderne de la théorie de l'évolution implique la biologie des populations et, à un niveau encore plus petit, la génétique des populations. L'évolution étant mesurée en unités au sein des populations et seules les populations peuvent évoluer et non individus, la biologie et la génétique des populations sont des éléments complexes de la théorie de L'évolution à travers Sélection naturelle.
Quand Charles Darwin a d'abord publié ses idées sur l'évolution et la sélection naturelle, le domaine de la génétique reste à découvrir. Étant donné que le traçage des allèles et de la génétique est une partie très importante de la biologie et de la génétique des populations, Darwin n'a pas entièrement couvert ces idées dans ses livres. Maintenant, avec plus de technologie et de connaissances sous nos ceintures, nous pouvons intégrer plus de biologie et de génétique des populations dans la théorie de l'évolution.
Une façon de le faire est par la coalescence des allèles. Les biologistes de la population examinent
pool de gènes et tous les allèles disponibles au sein de la population. Ils essaient ensuite de retracer l'origine de ces allèles dans le temps pour voir où ils ont commencé. Les allèles peuvent être retracés à travers différentes lignées sur un phylogénétique arbre pour voir où ils fusionnent ou se réunissent (une autre façon de le voir est lorsque le allèles ramifiés les uns des autres). Les traits fusionnent toujours à un point appelé l'ancêtre commun le plus récent. Après l'ancêtre commun le plus récent, les allèles se sont séparés et ont évolué en de nouveaux traits et très probablement les populations ont donné naissance à de nouvelles espèces.The Coalescent Theory, un peu comme Équilibre Hardy-Weinberg, a quelques hypothèses qui éliminent les changements d'allèles par le biais d'événements aléatoires. La théorie de la coalescence suppose qu'il n'y a pas de flux génétique aléatoire ou de dérive génétique des allèles dans ou hors des populations, la sélection naturelle est ne fonctionne pas sur la population sélectionnée au cours de la période donnée, et il n'y a pas de recombinaison d'allèles pour former de nouveaux ou plus complexes allèles. Si cela est vrai, l'ancêtre commun le plus récent peut être trouvé pour deux lignées différentes d'espèces similaires. Si l'un des éléments ci-dessus est en jeu, plusieurs obstacles doivent être surmontés avant que l'ancêtre commun le plus récent puisse être identifié pour ces espèces.
À mesure que la technologie et la compréhension de la théorie de la coalescence deviennent plus facilement disponibles, le modèle mathématique qui l'accompagne a été modifié. Ces modifications du modèle mathématique permettent de résoudre certains des problèmes auparavant inhibiteurs et complexes de la biologie des populations et la génétique des populations a été prise en charge et tous les types de populations peuvent ensuite être utilisés et examinés théorie.