Les champignons sont des organismes eucaryotes, comme les plantes et les animaux. Contrairement aux plantes, elles ne fonctionnent pas photosynthèse et ils ont de la chitine, un dérivé du glucose, dans leurs parois cellulaires. Comme les animaux, les champignons sont hétérotrophes, ce qui signifie qu'ils obtiennent leurs nutriments en les absorbant.
Bien que la plupart des gens pensent qu'une différence entre les animaux et les champignons est que les champignons sont immobiles, certains champignons sont mobiles. La vraie différence est que les champignons contiennent une molécule appelée bêta-glucane, un type de fibre, dans leurs parois cellulaires.
Bien que tous les champignons partagent certaines caractéristiques communes, ils peuvent être divisés en groupes. Cependant, les scientifiques qui étudient les champignons (mycologues) ne sont pas d'accord sur la meilleure structure taxonomique. La classification d'un simple profane consiste à les diviser en champignons, levures et moisissures. Les scientifiques ont tendance à reconnaître sept sous-domaines ou phylums de champignons.
Dans le passé, les champignons étaient classés selon leur physiologie, leur forme et leur couleur. Les systèmes modernes s'appuient sur la génétique moléculaire et les stratégies de reproduction pour les regrouper. Gardez à l'esprit que les phylums suivants ne sont pas gravés dans le marbre. Les mycologues sont même en désaccord sur les noms des espèces
Les champignons les plus connus appartiennent probablement au sous-royaume Dikarya, qui comprend tous les champignons, la plupart des agents pathogènes, les levures et les moisissures. Subkingdom Dikarya est divisé en deux phylums, Ascomycota et Basidiomycota. Ces phylums et les cinq autres qui ont été proposés sont différenciés en fonction principalement des structures de reproduction sexuelle.
Le plus grand embranchement de champignons est Ascomycota. Ces champignons sont appelés ascomycètes, ou champignons sac, car leurs spores méiotiques (ascospores) se trouvent dans un sac appelé asque. Ce phylum comprend des levures unicellulaires, des lichens, des moisissures, des truffes, de nombreux champignons filamenteux et quelques champignons. Ce phylum contribue aux champignons utilisés pour fabriquer de la bière, du pain, du fromage et des médicaments. Les exemples comprennent Aspergillus et Penicillium.
Les champignons du club, ou basidiomycètes, appartenant au phylum Basidiomycota produire des basidiospores sur des structures en forme de club appelées basides. Le phylum comprend les champignons les plus communs, les champignons du charbon et la rouille. De nombreux agents pathogènes des céréales appartiennent à ce phylum. Cryptococcus neoformans est un parasite humain opportuniste. Ustilago maydis est un agent pathogène du maïs.
Champignons appartenant au phylum Chytridiomycota sont appelés chytrides. Ils sont l'un des rares groupes de champignons à motilité active, produisant des spores qui se déplacent à l'aide d'un seul flagelle. Les chytrides obtiennent des nutriments en dégradant la chitine et la kératine. Certains sont parasites. Les exemples comprennent Batrachochytrium dendobatidis, qui provoque une maladie infectieuse appelée chytridiomycose chez les amphibiens.
Stuart, S. N.; Chanson J. S.; et al. (2004). "Statut et tendances des déclins et extinctions d'amphibiens dans le monde." Science. 306 (5702): 1783–1786.
Membres du phylum Blastocladiomycota sont des parents proches des chytrides. En fait, ils étaient considérés comme appartenant au phylum avant que les données moléculaires ne les conduisent à se séparer. Les blastocladiomycètes sont des saprotrophes qui se nourrissent de matières organiques en décomposition, comme le pollen et la chitine. Certains sont des parasites d'autres eucaryotes. Alors que les chytrides sont capables de méiose zygotique, les blastocladiomycètes effectuent une méiose sporique. Membres de l'exposition phylum alternance de générations.
Des exemples sont Allomyces macrogynus, Blastocladiella emersonii, et Physoderma maydis.
Le phylum Microsporidia contient des champignons qui sont des parasites unicellulaires sporulateurs. Ces parasites infectent les animaux et les protistes, un organisme unicellulaire. Chez l'homme, l'infection est appelée microsporidiose. Les champignons se reproduisent dans la cellule hôte et libèrent des cellules. Contrairement à la plupart des cellules eucaryotes, les microsporidies manquent de mitochondries. L'énergie est produite dans des structures appelées mitosomes. Les microsporidies ne sont pas mobiles.
Les néocallimastigomycètes appartiennent au phylum Neocallimastigomycota, un petit embranchement de champignons anaérobies. Ces organismes manquent de mitochondries. Au lieu de cela, leurs cellules contiennent des hydrogénosomes. Ils forment des zoospores mobiles qui ont une ou plusieurs flagelles. Ces champignons se trouvent dans des environnements riches en cellulose, tels que les systèmes digestifs des herbivores ou dans les décharges. Ils ont également été trouvés chez l'homme. Chez les ruminants, les champignons jouent un rôle essentiel dans la digestion des fibres.
D'autres organismes ressemblent et agissent comme des champignons mais ne sont pas membres du royaume. Les moisissures visqueuses ne sont pas considérées comme des champignons car elles n'ont pas toujours de paroi cellulaire et parce qu'elles ingèrent des nutriments plutôt que de les absorber. Les moisissures aqueuses et les hyphochytrides sont d'autres organismes qui ressemblent à des champignons mais ne sont plus classés avec eux.