Guide complet des Denisoviens, nouvelles espèces d'hominidés

Les Denisoviens sont récemment identifiés hominin espèces apparentées, mais différentes des deux autres espèces d'hominidés (humains et Néandertaliens) qui ont partagé notre planète pendant les périodes du Paléolithique moyen et supérieur. Les preuves archéologiques de l'existence des Denisoviens sont jusqu'à présent limitées, mais les preuves génétiques suggèrent qu'elles étaient autrefois répandues en Eurasie et croisées avec les Néandertaliens et les humains modernes.

Points clés: Denisovans

  • Denisovan est le nom d'un hominidé éloigné des Néandertaliens et des humains anatomiquement modernes.
  • Découvert par la recherche génomique en 2010 sur des fragments d'os de la grotte Denisova, en Sibérie
  • Les preuves sont principalement des données génétiques de l'os et des humains modernes qui portent les gènes
  • Associé positivement au gène qui permet aux humains de vivre à haute altitude
  • Une mandibule droite a été trouvée dans une grotte du plateau tibétain

Les premiers vestiges étaient de minuscules fragments trouvés dans les couches initiales du Paléolithique supérieur de

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Grotte Denisova, dans le nord-ouest des montagnes de l'Altaï à environ six kilomètres du village de Chernyi Anui en Sibérie, en Russie. Les fragments contenaient de l'ADN, et le séquençage de cette histoire génétique et la découverte de restes de ces gènes dans les populations humaines modernes a des implications importantes pour l'habitation humaine de notre planète.

Grotte Denisova

Les premiers restes des Denisoviens étaient deux dents et un petit fragment d'os de doigt du niveau 11 de la grotte Denisova, un niveau daté entre 29 200 et 48 650 ans. Les restes contiennent une variante de l'initiale Paléolithique supérieur vestiges culturels trouvés en Sibérie appelé Altaï. Découverts en 2000, ces restes fragmentaires sont la cible d'investigations moléculaires depuis 2008. Cette découverte est intervenue après que des chercheurs dirigés par Svante Pääbo au Projet sur le génome néandertalien au Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology a terminé avec succès le premier ADN mitochondrial (ADNmt) séquence d'un Néandertalien, prouvant que les Néandertaliens et les premiers humains modernes ne sont pas très étroitement liés du tout.

En mars 2010, l'équipe de Pääbo a rendu compte des résultats de l'examen d'un des petits fragments, une phalange (os du doigt) d'un enfant âgé de 5 à 7 ans, trouvée au niveau 11 de la grotte Denisova. La signature de l'ADNmt de la phalange de la grotte Denisova était significativement différente des deux Néandertaliens ou premiers humains modernes (EMH). Une analyse complète de l'ADNmt de la phalange a été rapportée en décembre 2010, et elle a continué de soutenir l'identification de l'individu Denisovan comme distinct de Néandertal et de l'EMH.

Pääbo et ses collègues croient que l'ADNmt de cette phalange provient d'un descendant de personnes qui ont quitté l'Afrique un million d'années après l'homo erectus, et un demi-million d'années avant les ancêtres des Néandertaliens et de l'EMH. Essentiellement, ce minuscule fragment est la preuve d'une migration humaine hors d'Afrique que les scientifiques ignoraient complètement avant cette découverte.

La molaire

L'analyse de l'ADNmt d'une molaire du niveau 11 dans la grotte et rapportée en décembre 2010 a révélé que la dent était probablement d'un jeune adulte du même hominidé que l'os du doigt et clairement un individu différent puisque la phalange est d'un enfant.

La dent est une molaire gauche presque complète et probablement la troisième ou la deuxième molaire supérieure, avec des parois linguales et buccales bombées, ce qui lui donne un aspect gonflé. La taille de cette dent est bien en dehors de la plage pour la plupart des espèces Homo. En fait, sa taille est la plus proche de Australopithèque. Ce n'est absolument pas une dent de Néandertal. Plus important encore, les chercheurs ont pu extraire l'ADN de la dentine à l'intérieur de la racine de la dent, et les résultats préliminaires ont rapporté son identification en tant que Denisovan.

La culture des Denisovans

Ce que nous savons de la culture des Denisoviens, c'est qu'elle n'était apparemment pas très différente des autres populations initiales du Paléolithique supérieur dans le nord de la Sibérie. Les outils en pierre dans les couches où se trouvaient les restes humains de Denisov sont une variante de Moustérien, avec l'utilisation documentée d'une stratégie de réduction parallèle pour les noyaux, et un grand nombre d'outils formés sur de grandes lames.

Des objets décoratifs en os, en défense de mammouth et en coquille d'autruche fossilisée ont été récupérés dans la grotte Denisova, tout comme deux fragments d'un bracelet en pierre en chlorite vert foncé. Les niveaux de Denisovan contiennent l'utilisation la plus ancienne d'une aiguille à os oculaire connue en Sibérie à ce jour.

Séquençage du génome

En 2012, l'équipe de Pääbo a rendu compte de la cartographie du séquençage complet du génome de la dent. Les Denisoviens, comme les humains modernes aujourd'hui, partagent apparemment un ancêtre commun avec les Néandertaliens mais ont une histoire de population complètement différente. Alors que l'ADN néandertalien est présent dans toutes les populations en dehors de l'Afrique, l'ADN de Denisovan ne se trouve que dans les populations modernes de Chine, des îles d'Asie du Sud-Est et d'Océanie.

Selon l'analyse de l'ADN, les familles des humains d'aujourd'hui et des Denisoviens se sont séparées il y a environ 800 000 ans, puis se sont reconnectées il y a environ 80 000 ans. Les Denisoviens partagent le plus d'allèles avec les populations Han du sud Chine, avec Dai dans le nord de la Chine, et avec les Mélanésiens, les aborigènes australiens et les insulaires du sud-est asiatique.

Les individus dénisoviens trouvés en Sibérie portaient des données génétiques qui correspondent à celles des humains modernes et sont associées à une peau foncée, des cheveux bruns et des yeux bruns.

Tibétains, ADN Denisovan et Xiahe

Seeting de la grotte karstique de Biashiya sur le plateau tibétain
En regardant à travers toute la vallée de la rivière Jiangla à la partie supérieure de la vallée. La grotte karstique de Biashiya se trouve au fond de la vallée.Dongju Zhang, Université de Lanzhou

Une étude d'ADN publiée par la généticienne des populations Emilia Huerta-Sanchez et ses collègues dans la revue La nature axé sur la structure génétique des personnes qui vivent sur le Plateau Tibétain à 4000 mètres d'altitude et a découvert que les Denisoviens ont peut-être contribué à la capacité des Tibétains à vivre à haute altitude. Le gène EPAS1 est une mutation qui réduit la quantité d'hémoglobine dans le sang nécessaire aux personnes pour se maintenir et prospérer à haute altitude avec un faible taux d'oxygène. Les personnes qui vivent à des altitudes plus basses s'adaptent aux faibles niveaux d'oxygène à haute altitude en augmentant la quantité d'hémoglobine dans leurs systèmes, ce qui augmente à son tour le risque d'événements cardiaques. Mais les Tibétains peuvent vivre à des altitudes plus élevées sans augmentation du taux d'hémoglobine. Les chercheurs ont recherché des populations de donneurs pour EPAS1 et ont trouvé une correspondance exacte dans l'ADN de Denisovan. La grotte Denisova n'est qu'à environ 2 300 pieds au-dessus du niveau de la mer; le plateau tibétain mesure en moyenne 16 400 pieds asl.

Une équipe dirigée par le paléontologue Jean-Jacques Hublin (Chen 2019) a fouillé les archives paléontologiques tibétaines archivées reste et a identifié une mandibule qui avait été découverte dans la grotte karstique de Baishiya, Xiahe, province du Gansu, Chine en 1980. La mandibule Xiahe a 160 000 ans et représente le plus ancien fossile d'hominine connu trouvé sur le plateau tibétain - l'altitude de la grotte est de 10 700 pieds asl. Bien qu'aucun ADN ne soit resté dans la mandibule Xiahe elle-même, il y avait un protéome existant dans la dentine de les dents, bien que très dégradées, se distinguaient encore clairement de la contamination des protéines. Un protéome est l'ensemble de toutes les protéines exprimées dans une cellule, un tissu ou un organisme; et l'état observé d'un polymorphisme d'un seul acide aminé particulier dans le protéome Xiahe a aidé à établir l'identification du Xiahe comme Denisovan. Les chercheurs pensent que cette adaptation humaine à des environnements extraordinaires pourrait avoir été facilitée par le flux génétique de Denisoviens qui s'étaient d'abord adaptés au climat.

Maintenant que les chercheurs ont une idée de la morphologie de la mâchoire Denisovienne, il sera plus facile d'identifier les candidats Denisoviens possibles. Chen et al. a également suggéré deux autres os d'Asie de l'Est qui correspondent à la morphologie et au calendrier de la grotte Xiahe, Penghu 1 et Xuijiayo.

Arbre généalogique

Lorsque les humains anatomiquement modernes ont quitté l'Afrique il y a environ 60 000 ans, les régions dans lesquelles ils sont arrivés étaient déjà peuplées: par les Néandertaliens, les anciennes espèces d'Homo, les Denisoviens et peut-être Homo floresiensis. Dans une certaine mesure, l'AMH s'est croisée avec ces autres hominidés. Les recherches les plus récentes indiquent que toutes les espèces d'hominidés descendent du même ancêtre, un hominin d'Afrique; mais l'origine exacte, la datation et la propagation des hominidés dans le monde étaient un processus complexe qui nécessite beaucoup plus de recherches pour être identifié.

Des recherches menées par Mondal et al. (2019) et Jacobs et al. (2019) ont établi que des populations modernes contenant des mélanges d'ADN de Denisovan se trouvent dans toute l'Asie et l'Océanie, et il devient clair que le métissage entre les humains anatomiquement modernes et les Denisoviens et les Néandertaliens s'est produit plusieurs fois au cours de notre histoire sur la planète Terre.

Sources sélectionnées

  • Árnason, Úlfur. "L'hypothèse de l'Afrique et l'ascendance des humains récents: Cherchez La Femme (Et L'homme)." Gène 585.1 (2016): 9–12. Impression.
  • Bae, Christopher J., Katerina Douka et Michael D. Petraglia. "Sur l'origine des humains modernes: perspectives asiatiques." Science 358.6368 (2017). Impression.
  • Chen, Fahu et al. "Mandibule Denisovienne du Pléistocène moyen tardif du plateau tibétain." La nature (2019). Impression.
  • Douka, Katerina et al. "Estimations d'âge pour les fossiles d'hominine et le début du Paléolithique supérieur à la grotte Denisova." La nature 565.7741 (2019): 640–44. Impression.
  • Garrels, J. JE. "Protéome." Encyclopédie de la génétique. Eds. Brenner, Sydney et Jefferey H. Meunier. New York: Academic Press, 2001. 1575–78. Impression
  • Huerta-Sanchez, Emilia, et al. "L'adaptation à l'altitude chez les Tibétains causée par l'introgression de l'ADN de type Denisovan." La nature 512.7513 (2014): 194–97. Impression.
  • Jacobs, Guy S. et al. "Plusieurs ancêtres Denisovan profondément divergents chez les Papous." Cellule 177,4 (2019): 1010–21.e32. Impression.
  • Mondal, Mayukh, Jaume Bertranpetit et Oscar Lao. "Le calcul bayésien approximatif avec apprentissage profond soutient une troisième introgression archaïque en Asie et en Océanie." Communications Nature 10.1 (2019): 246. Impression.
  • Slon, Viviane et al. "Le génome de la progéniture d'une mère néandertalienne et d'un père Denisovan." La nature 561.7721 (2018): 113–16. Impression.
  • Slon, Viviane et al. "Un quatrième individu Denisovan." Avancées scientifiques 3,7 (2017): e1700186. Impression.
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