Les conditions qui ont capturé les soldats de l’Union ont perduré à la Confédération Prison d'Andersonville étaient horribles. Pendant les 18 mois de fonctionnement de la prison, près de 13 000 soldats de l'Union sont morts de malnutrition, maladie et exposition aux éléments en raison de traitements inhumains par le commandant d'Andersonville Henry Wirz. Il n'est donc pas surprenant que ses poursuites pour crimes de guerre après la reddition du Sud soient le procès le plus connu résultant de la Guerre civile. Mais il n'est pas aussi communément connu qu'il y eut près d'un millier d'autres poursuites militaires contre les confédérés. Beaucoup d'entre eux étaient dus aux mauvais traitements infligés aux soldats de l'Union capturés.
Henry Wirz
Henry Wirz a pris le commandement de la prison d'Andersonville le 27 mars 1864, environ un mois après l'arrivée des premiers prisonniers. L'un des premiers actes de Wirz a été de créer une zone appelée la barrière de la ligne morte, conçue pour accroître la sécurité en éloignant les prisonniers du mur de la palissade. Tout prisonnier qui franchissait la «ligne de mort» était susceptible d'être abattu par les gardiens de la prison. Pendant le règne de Wirz en tant que commandant, il a utilisé des menaces pour maintenir les prisonniers en ligne. Lorsque les menaces ne semblaient pas fonctionner, Wirz a ordonné aux sentinelles de tirer sur les prisonniers. Dans
Mai 1865, Wirz a été arrêté à Andersonville et transporté à Washington DC. attendre son procès. Wirz a été jugé pour complot en vue de blesser et / ou de tuer des soldats capturés en leur refusant à tort l'accès à la nourriture, aux fournitures médicales et aux vêtements. Il a également été inculpé de meurtre pour avoir personnellement exécuté un certain nombre de prisonniers.Environ 150 témoins ont déposé contre Wirz lors de son procès militaire, qui a duré du 23 août au 18 octobre 1865. Après avoir été reconnu coupable de toutes les charges retenues contre lui, Wirz a été condamné à mort et pendu le 10 novembre 1865.
James Duncan
James Duncan était un autre officier de la prison d'Andersonville qui a également été arrêté. Duncan, qui avait été affecté au bureau du quartier-maître, a été reconnu coupable d'homicide involontaire coupable pour avoir intentionnellement refusé de nourrir les prisonniers. Il a été condamné à 15 ans de travaux forcés mais s'est évadé après avoir purgé seulement un an de sa peine.
Champ Ferguson
Au début de la guerre civile, Champ Ferguson était fermier dans l'est du Tennessee. La population de cette région était assez également répartie entre le soutien à l'Union et à la Confédération. Ferguson a organisé une compagnie de guérilla qui a attaqué et tué des sympathisants de l'Union. Ferguson a également agi comme éclaireur pour le colonel Cavalerie Kentucky de John Hunt Morganet Morgan a promu Ferguson au grade de capitaine des partisans Rangers. Le Congrès confédéré a adopté une mesure appelée Partisan Ranger Act qui a permis le recrutement d'irréguliers en service. Il convient de noter qu'en raison d'un manque de discipline parmi les Rangers partisans, le général Robert E. Lee a appelé à l'abrogation de la loi par le Congrès confédéré en février 1864. Après un procès devant un tribunal militaire, Ferguson a été reconnu coupable d'avoir tué plus de 50 soldats de l'Union capturés. Il est exécuté par pendaison en octobre 1865.
Robert Kennedy
Robert Kennedy était un officier confédéré qui avait été capturé par les forces de l'Union et incarcéré à la prison militaire de Johnson’s Island. La prison était située dans la baie de Sandusky, sur la côte du lac Érié, à quelques kilomètres de Sandusky, en Ohio. Kennedy s'est échappé de l'île Johnson en octobre 1864, se dirigeant vers le Canada - qui a maintenu la neutralité des deux côtés. Kennedy a rencontré plusieurs officiers confédérés qui utilisaient le Canada comme rampe de lancement pour mener des actes de guerre contre l'Union. Il a participé à un complot pour déclencher des incendies dans de nombreux hôtels, ainsi que dans un musée et un théâtre à New York, avec l'intention de submerger les autorités locales. Tous les incendies ont été éteints rapidement ou n'ont causé aucun dommage. Kennedy était le seul à avoir été capturé. Après un procès devant un tribunal militaire, Kennedy est exécuté par pendaison en mars 1865.