(2) Dans le Théorie de Bronsted-Lowry des acides et des bases, le terme conjugué désigne un acide et une base qui diffèrent l'un de l'autre par un proton. Lorsqu'un acide et une base réagissent, l'acide forme sa base conjuguée tandis que la base forme son acide conjugué:
La flèche de réaction pointe à la fois vers la gauche et vers la droite car la réaction à l'équilibre se produit à la fois la direction avant pour former les produits et la direction inverse pour reconvertir les produits en réactifs. L'acide perd un proton pour devenir sa base conjuguée A- comme la base B accepte un proton pour devenir son acide conjugué HB+.
(3) La conjugaison est le chevauchement de p-orbitales sur une liaison σ (sigma bond). Dans les métaux de transition, les orbitales D peuvent se chevaucher. Les orbitales ont des électrons délocalisés lorsqu'il y a alternance de liaisons simples et multiples dans une molécule. Les liaisons alternent dans une chaîne tant que chaque atome a une orbite p disponible. La conjugaison a tendance à abaisser l'énergie de la molécule et à augmenter sa stabilité.
La conjugaison est courante dans les polymères conducteurs, les nanotubules de carbone, le graphène et le graphite. On le voit dans de nombreuses molécules organiques. Entre autres applications, les systèmes conjugués peuvent former des chromophores. Les chromophores sont des molécules qui peuvent absorber certaines longueurs d'onde de la lumière, ce qui les amène à être colorées. Les chromophores se trouvent dans les colorants, les photorécepteurs de l'œil et brillent dans les pigments sombres.