Cela se produit le plus souvent en raison de l'isolement géographique ou de l'isolement reproductif des individus au sein de la population. Au fur et à mesure que les espèces évoluent et se ramifient, elles ne peuvent plus se croiser avec des membres de l'espèce d'origine.
Quatre types de spéciation naturelle peuvent se produire en fonction de l'isolement reproductif ou géographique, entre autres raisons et facteurs environnementaux.
Le préfixe allo- signifie "autre". Le suffixe -patrique, signifie "lieu". L'allopatrie est donc un type de spéciation causée par l'isolement géographique. Les individus isolés sont littéralement dans un «autre endroit».
Le mécanisme le plus courant d'isolement géographique est une véritable barrière physique qui s'installe entre les membres d'une population. Cela peut être quelque chose d'aussi petit qu'un arbre tombé pour les petits organismes ou aussi grand que d'être divisé par les océans.
La spéciation allopatrique ne signifie pas nécessairement que les deux populations distinctes ne peuvent pas interagir ni même se reproduire au début. Si la barrière à l'origine de l'isolement géographique peut être surmontée, certains membres des différentes populations peuvent voyager dans les deux sens. Mais la majorité des populations resteront isolées les unes des autres et, par conséquent, elles divergent en différentes espèces.
Le préfixe péri- signifie "proche". Lorsqu'il est ajouté au suffixe -patrique, cela se traduit par "lieu proche". La spéciation péripatrique est en fait un type spécial de spéciation allopatrique. Il existe toujours une sorte d'isolement géographique, mais il existe également une sorte d'instance qui fait que très peu d'individus survivent dans la population isolée par rapport à la spéciation allopatrique.
Dans la spéciation péripatrique, il peut s'agir d'un cas extrême d'isolement géographique où seuls quelques individus sont isolés, ou pourrait suivre non seulement un isolement géographique, mais aussi une sorte de catastrophe qui tue tous sauf quelques-uns des isolés population. Avec un si petit pool génétique, des gènes rares sont transmis plus souvent, ce qui dérive génétique. Les individus isolés deviennent rapidement incompatibles avec leurs anciennes espèces et deviennent une nouvelle espèce.
Le suffixe -patrique signifie toujours "lieu" et quand le préfixe para-, ou "à côté", est attaché, cela implique que cette fois les populations ne sont pas isolées par une barrière physique et sont plutôt "côte à côte".
Même si rien n'empêche les individus de toute la population de se mélanger et de s'accoupler, cela ne se produit toujours pas dans la spéciation parapatrique. Pour une raison quelconque, les individus de la population ne s'accouplent qu'avec des individus dans leur région immédiate.
Certains facteurs qui pourraient influencer la spéciation parapatrique comprennent la pollution ou l'incapacité de répandre des graines pour les plantes. Cependant, pour être classée comme spéciation parapatrique, la population doit être continue sans barrières physiques. S'il existe des barrières physiques, elles doivent être classées comme isolement péripatrique ou allopatrique.
Le dernier type est appelé spéciation sympatrique. Le préfixe sym-, signifiant "identique" avec le suffixe -patrique, ce qui signifie "lieu" donne un indice sur le sens de ce type de spéciation: les individus de la population sont pas du tout séparés et tous vivent au "même endroit". Alors, comment les populations divergent-elles si elles vivent dans la même espace?
La cause la plus courante de spéciation sympatrique est l'isolement reproductif. L'isolement reproductif peut être dû au fait que les individus entrent dans leur saison de reproduction à des moments différents ou à la préférence de l'endroit où trouver un partenaire. Dans de nombreuses espèces, le choix des partenaires peut être basé sur leur éducation. De nombreuses espèces retournent là où elles sont nées pour s'accoupler. Par conséquent, ils ne pourraient s'accoupler qu'avec d'autres personnes nées au même endroit, peu importe où ils se déplacent et vivent comme des adultes.
D'autres raisons pourraient être que différentes populations deviennent dépendantes de différents besoins dans l'environnement, tels que les sources de nourriture ou les abris.