Les reptiles sont un groupe de vertébrés à quatre pattes (également appelés tétrapodes) qui ont divergé des amphibiens ancestraux il y a environ 340 millions d'années. Il y a deux caractéristiques que les premiers reptiles ont développées qui les distinguent de leurs ancêtres amphibiens et qui leur permettent de coloniser les habitats terrestres dans une plus large mesure que les amphibiens. Ces caractéristiques sont des écailles et des œufs amniotiques (œufs avec une membrane liquide interne).
Crocodiliens sont un groupe de grands reptiles qui comprend des alligators, des crocodiles, des gavials et des caïmans. Les crocodiliens sont de formidables prédateurs avec des mâchoires puissantes, une queue musclée, de grandes écailles protectrices, un corps profilé et des yeux et des narines positionnés au sommet de leur tête. Les crocodiliens sont apparus pour la première fois il y a environ 84 millions d'années au cours du Crétacé supérieur et sont les parents vivants les plus proches des oiseaux. Les crocodiliens ont peu changé au cours des 200 derniers millions d'années. Il existe aujourd'hui environ 23 espèces de crocodiliens.
Les squamates sont le plus diversifié de tous les groupes de reptiles, avec environ 7 400 espèces vivantes. Les squamates comprennent les lézards, les serpents et les lézards à vers. Les squamates sont apparus pour la première fois dans les archives fossiles au milieu du Jurassique et existaient probablement avant cette époque. Les archives fossiles pour les squamates sont plutôt clairsemées. Les squamates modernes sont apparus il y a environ 160 millions d'années, à la fin du Jurassique. Les premiers fossiles de lézards ont entre 185 et 165 millions d'années.
Tuatara est un groupe de reptiles qui ressemblent à des lézards, mais ils diffèrent des squamates en ce que leur crâne n'est pas articulé. Le tuatara était autrefois très répandu, mais il ne reste aujourd'hui que deux espèces de tuatara. Leur aire de répartition est désormais limitée à quelques îles de la Nouvelle-Zélande. Le premier tuatara est apparu à l'époque mésozoïque, il y a environ 220 millions d'années, à peu près au même moment où les premiers dinosaures sont apparus. Les parents vivants les plus proches des tuatara sont les squamates.
Les tortues sont parmi les plus anciens des reptiles vivants aujourd'hui et ont peu changé depuis leur apparition il y a environ 200 millions d'années. Ils ont une coque de protection qui entoure leur corps et offre une protection et un camouflage. Les tortues vivent dans les habitats terrestres, d'eau douce et marins et se trouvent à la fois dans les régions tropicales et tempérées. Les premières tortues sont apparues il y a plus de 220 millions d'années à la fin du Trias. Depuis ce temps, les tortues ont peu changé et il est fort possible que les tortues modernes ressemblent étroitement à celles qui parcouraient la Terre à l'époque des dinosaures.